盖博士遮盖液治白癜风效果好不好 http://m.39.net/baidianfeng/a_4328638.html

多组学联合分析常用的包为MatrixeQTL，官方文章为MatrixeQTL:ultrafasteQTLanalysisvialargematrixoperations

eQTL（表达数量性状位点）计算transcript-SNP的关系，即分析SNP与基因的表达是否相关。由于计算数量巨大，很多人都用较小的数据来做。因此该作者开发了MatrixeQTL，用于处理大数据，支持additivelinearandANOVAmodelswithcovariates，并且可以将cis-andtrans-eQTLs分开计算。

MatrixeQTL相较于其他软件如FastMap—18.4min，Merlin—12.3min，Plink—9.0min，MatrixeQTL—5.7min和snpMatrix—3.3min要快，它设置一个阈值，只有超过这个阈值的p值才会被计算。

采用的是线型回归模型，g为基因表达情况，s为SNP分型结果。

说明文档: